Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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