Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C18orf8Q96DM3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms