Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf4Q8VI88 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf4Q8VI88 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf4Q8VI88 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf4Q8VI88 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf4Q8VI88 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf4Q8VI88 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf4Q8VI88 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf4Q8VI88 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms