Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms