Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc12Q8R344 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc12Q8R344 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms