Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms