Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynprQ8BGN8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms