Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc1Q80VQ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms