Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim17Q7TPM3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms