Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms