Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mvb12bQ6KAU4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms