Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb1i1Q62219 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb1i1Q62219 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms