Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC39AQ5SRH9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms