Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc114Q3UX62 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms