Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rmi2Q3UPE3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rmi2Q3UPE3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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