Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms