Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U595 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U595 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U595 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U595 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U595 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U595 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U595 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U595 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U595 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U595 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U595 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U595 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U595 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U595 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U595 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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