Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc136Q3TVA9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms