Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms