Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptcd3Q14C51 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptcd3Q14C51 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms