Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms