Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms