Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms