Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms