Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn18P56857 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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