Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx2-5P42582 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx2-5P42582 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms