Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab17P35292 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms