Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif5cP28738 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms