Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjc1P28229 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms