Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb9P28076 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms