Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms