Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms