Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClockO08785 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClockO08785 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClockO08785 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClockO08785 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClockO08785 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClockO08785 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClockO08785 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClockO08785 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClockO08785 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClockO08785 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClockO08785 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClockO08785 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClockO08785 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClockO08785 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClockO08785 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClockO08785 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClockO08785 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClockO08785 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClockO08785 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms