Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna5O08543 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna5O08543 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efna5O08543 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna5O08543 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna5O08543 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna5O08543 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna5O08543 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna5O08543 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms