Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2035J3QP87 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2035J3QP87 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2035J3QP87 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm2035J3QP87 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm2035J3QP87 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm2035J3QP87 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm2035J3QP87 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2035J3QP87 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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