Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms