Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn34c3J3QJW5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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