Protein–RNA interactions for Protein: E0CXM8

Gm43720, Predicted gene 43720, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43720E0CXM8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm43720E0CXM8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm43720E0CXM8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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