Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc183A2AJB1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms