Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms