Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 CT009536.1-201ENSMUST00000223774 2151 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Aoc1-203ENSMUST00000162948 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Abca8a-202ENSMUST00000100287 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Abca8a-204ENSMUST00000106664 5617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Napg-201ENSMUST00000025474 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Snapc4-202ENSMUST00000114115 4368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Wdr48-205ENSMUST00000215307 3776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Ap3b1-201ENSMUST00000022196 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Bdnf-206ENSMUST00000111046 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm26184-201ENSMUST00000157686 131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Anpep-202ENSMUST00000107392 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Hgd-203ENSMUST00000160847 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Serpina3f-201ENSMUST00000101080 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Rnf6-208ENSMUST00000169407 3276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Olfr545-202ENSMUST00000216116 3496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm42895-201ENSMUST00000200761 2996 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm19705-201ENSMUST00000180495 496 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm8512-201ENSMUST00000215367 471 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chic1Q8CBW7 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.1 ms