Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11aQ9QYE3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms