Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms