Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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