Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp4Q9JIL5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp4Q9JIL5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms