Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aph1cQ9DCZ9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms