Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms