Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Tmed11Q9D2R4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Tmed11Q9D2R4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed11Q9D2R4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Tmed11Q9D2R4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Tmed11Q9D2R4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Tmed11Q9D2R4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmed11Q9D2R4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmed11Q9D2R4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmed11Q9D2R4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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