Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms