Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmd8Q9CX56 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms